​​论文写作 | 基因和蛋白质名称写法混乱，你真的有考虑它们的感受吗？

近一段时间通过了解，我们发现很多作者在撰写学术论文时完全依照自己的心情书写基因与蛋白质的名称，通常都是大小写、斜正体混用，没有遵循最基本的格式规范。这不禁让我们联想到如果自己的姓名被别人乱写，心里肯定不是个滋味儿，也许这些基因与蛋白质也有同样的心情吧，所以在撰写学术论文的时候，也要多考虑考虑它们的感受才可以。

在描述基因或蛋白质研究的学术论文中，如果没有按照规范的格式来书写它们的名称和符号，广大论文的读者们通常都很难确定作者所指的究竟是基因还是其对应的蛋白质，尤其是当别人试图深入了解论文中所涉及的复杂分子系统细节或希望系统性探索该研究所使用的具体方法时，就会出现大的问题。

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同时，论文中不规范的基因与蛋白质名称书写方式，也会给期刊的同行评审专家留下“该文章的内容表述存在重大缺陷”、“该作者缺少相关的基本学术常识”、“该课题组对研究领域不够了解”等负面印象。为了减少与避免这些潜在的混淆问题与负面评价，今天我们为大家总结和科普一下学术论文中一些基本的与公认的基因和蛋白质名称与符号的书写方式。

基因与蛋白质名称与符号的通用规则

为了减少文献库中同基因的非重复性扩增，请大家始终使用标准的基因名称和符号，它们可以在特定生物的基因数据库中找到（例如，人类基因库genenames.org；植物基因库gramene.org；大鼠基因库rgd.mcw.edu；小鼠基因informatics.jax.org；斑马鱼基因zfin.org；果蝇基因flybase.org；蠕虫基因wormbase.org）。如果文章涉及基因的名称或符号还没有经过批准，可以向相关数据库或所在专业协会提交申请。

一般来说，基因的缩写符号均使用斜体（例如，IGF1），而蛋白质的缩写符号不使用斜体（例如，IGF1）。RNA和cDNA的符号通常遵循与基因符号相同的书写格式。如果多个基因同时被列举在同一张表格中，作者或期刊可自行决定是否将它们统一用斜体方式展示。完整的基因全称不使用斜体（例如，insulin-like growth factor 1），基因型名称应为斜体，而表型名称不用斜体。不同生物类型的基因和蛋白质也存在一些特定的格式公约，这些我们将在下面更加详细地讨论与阐述。

尽管同领域内的专家读者可能对您文章所涉及的基因和蛋白质名称符号比较熟悉，但非专家的大众读者通常并不能确定这些特定基因或蛋白质的缩写符号具体指代什么。因此，在论文首次出现某一基因或蛋白质时，需要提供该基因或蛋白质的完整名称，后添加括号注明相应的缩写符号（例如，insulin-like growth factor 1 (IGF1)）。

除了严格遵循基因和蛋白质名称与符号的公约法则之外，大家还可以在论文书写中通过刻意描述来强调基因和蛋白质之间的差异。在句式中明确指明基因还是蛋白质的表达会对读者的理解有所帮助，特别是在那些同时提及基因及其蛋白产物的句子中（例如，the IGF1 gene expression and IGF1 protein level were quantified）。当指代基因时，可以选择性地使用术语“表达（expression）”；当指代蛋白质时，可以选择性地使用术语“水平（level）”。

特定生物基因与蛋白质的名称与符号指南

尽管“基因斜体、蛋白正体”的一般法则适用于任何生物类型，但在基因和蛋白质名称符号的字母、数字、空格、字符、大小写等方面，不同生物体间仍存在一些差异。

小鼠、大鼠：基因全称不用斜体、不使用希腊字母、全部使用小写字母（例如，insulin-like growth factor 1）；基因缩写符号使用斜体、不使用希腊字母和连字符、首字母大写、其余字母小写（例如，Igf1）；蛋白质全称与基因全称规则相同；蛋白质缩写符号不使用斜体、所有字母均为大写（例如，IGF1）。

鱼：基因全称要用斜体表示、全部使用小写字母、不使用希腊字母（例如，brass）；基因缩写符号也为斜体、所有字母均为小写（例如，brs）；蛋白质完整名称不使用斜体（例如，brass）；蛋白质缩写符号不用斜体、首字母大写、其余字母小写（例如，Brs）。

蜥蜴：基因名称符号为斜体、小写字母（例如，shh）；蛋白质名称符号不为斜体、所有字母均为大写（例如，SHH）。

青蛙：基因名称符号为斜体、小写字母（例如，shh）；蛋白质名称符号不为斜体、首字母大写、其余字母小写（例如，Shh）。

果蝇：如果基因是以蛋白质名称命名的或最初以对野生型表型为显性的突变表型命名，基因的名称符号使用斜体、首字母大写、其余字母小写（例如，Rpp30)；如果基因最初以对野生型表型隐性的突变表型命名，则基因的名称符号使用斜体、所有字母均为小写（例如，kis）；以基因命名的蛋白质名称符号不用斜体、首字母大写、其余字母小写；对于不以基因命名的蛋白质名称符号，没有公认的格式规则。

植物：基因全称以大写斜体英文字母、空格和数字表示（例如，SHATTERING 1）；基因缩写符号用大写斜体字母直接连接数字表示（例如，SH1）；蛋白质全称与缩写符号通常与对应的基因命名方式一致，但不使用斜体（例如，SHATTERING 1与SH1）。

蠕虫：基因名称符号为斜体，通常由三至四个字母、一个连字符和一个阿拉伯数字组成（例如，abu-1）；蛋白质名称符号不为斜体，所有字母均为大写（例如，ABU-1）。

微生物：基因名称符号通常由三个小写斜体字母组成（例如，rpo），为了区分不同的等位基因，基因的缩写符号后通常添加一个大写字母（例如，rpoB ）；蛋白质名称符号不用斜体、首字母大写、其余字母小写（例如，RpoB）。

人类、非人类灵长类动物、其它家养物种：基因全称不用斜体、不使用希腊字母、全部使用小写字母（例如，insulin-like growth factor 1）；基因缩写符号通常包含三至六个斜体、大写字母，也可以是字母和阿拉伯数字的组合，但应始终要以字母开头（例如，IGF1），不能包含罗马数字、希腊字母或标点符号；蛋白质全称与基因全称规则相同；蛋白质缩写符号不使用斜体、所有字母均为大写（例如，IGF1）。

遵循以上这些基因与蛋白质书写名称的一般指南可以提高科学写作的准确性以防读者混淆概念，然而不同的学术期刊对特定的遗传术语有特殊的书写要求。因此，在提交文章至目标期刊之前，我们建议大家参照该学术期刊的作者指南检查文中的特定遗传术语是否已经符合期刊的要求。希望今天的内容能够让大家对基因与蛋白质名称的书写方式与格式有一个比较全面的认知。

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